الملخص
تم تحليل مجموعة من 2,734 مشاركًا (114 حالة سرطان ثدي مؤكدة بالخزعة و 2,620 مراقب بدون سرطان) باستخدام التحليل الاستقلابي غير الموجه LC-MS/MS من عينة دموية مجففة واحدة (DBS)، باستخدام نظام Thermo Scientific Orbitrap IQ-X متصل بنظام Vanquish UHPLC. تم تقييم لوحة محددة مسبقًا من 39 متوازن تحقق من معايير تحديد هوية MSI المستوى 1، تم اختيارها بناءً على سير عمل سابق محدد مسبقًا وتطبيقها هنا دون تغيير، باستخدام ست معماريات تعلم خاضع للإشراف قياسية (LASSO و Elastic Net و Linear SVM و PLS-DA و OPLS-DA و XGBoost). كانت أداء الكشف قوية عبر عائلات المصنفات، حيث وصلت إلى AUC بقيمة 0.928 لـ LASSO و 0.949 لـ XGBoost.
تعالج الورقة البحثية اثنين من الاختناقات المتكررة في التحليل الاستقلابي للدم لسرطان: الاعتماد شبه الحصري للمجال على المصل أو البلازما، والتي تتطلب البزل الوريدي وخدمات السلسلة الباردة، وبروتوكولات التعلم الآلي العمياء عن بنية الدفعات التحليلية وبالتالي تُبلِّغ عن أداء متحيزة بشكل متفائل. يزيل أخذ عينات DBS الحاجز اللوجستي، وتحافظ تصميم التحقق من الصحة على وعي الدفعات على صحة التقديرات المُبلَّغ عنها.
لماذا هذا مهم
هذا هو نظير تصنيف المرض لعمل التعرف الفردي في BioTwin: نفس مصفوفة DBS غير الغازية والتي يمكن جمعها ذاتيًا، ونفس بروتوكول LC-MS بمختبر واحد، والآن تم تطبيقه على الكشف المبكر عن سرطان الثدي. الاستقرار عبر ست عائلات مصنفات مستقلة، بدلاً من نموذج معاير واحد، هو ما يجعل الإشارة موثوقة.
المؤلفون
Nicolas Anctil (1)، Pierrick Hauguel (1)، Caroline Rhéaume (2)، Stephen Grobmyer (3)، Louis-Philippe Noel (1). المؤلف المراسل: Pierrick Hauguel (phauguel@biotwin.ai).
- قسم البحث والتطوير، BioTwin Inc.، Quebec City، QC، كندا
- Université Laval، Quebec City، QC، كندا
- معهد الأورام، مركز فاطمة بنت مبارك، Cleveland Clinic Abu Dhabi، أبو ظبي، الإمارات العربية المتحدة
تضارب المصالح: Nicolas Anctil و Pierrick Hauguel و Louis-Philippe Noel هم موظفو وأصحاب أسهم في BioTwin Inc.. Caroline Rhéaume و Stephen Grobmyer هما متعاونان أكاديميان وسريريان خارجيان.
ملاحظة مهمة: قد تناقش هذه المقالة أبحاث BioTwin، والرؤية الطبية، والمسارات السريرية المنظمة، أو التعليم الصحي والعافية من TwinMe. مخرجات العافية من TwinMe ليست اختبارات طبية أو تحليلات مختبرية. مخرجات BioTwin السريرية متاحة فقط حيث يكون ذلك مرخصًا وعبر متخصصين صحيين مؤهلين.