الملخص
حُلّلت مجموعة تضم 2,734 مشاركاً (114 حالة سرطان ثدي مؤكدة بالخزعة و2,620 شاهداً غير مصاب بالسرطان) بتحليل المستقلبات غير المستهدف بتقنية LC-MS/MS من بقعة دم مجفف واحدة (DBS)، باستخدام Thermo Scientific Orbitrap IQ-X مع نظام Vanquish UHPLC. واختُبرت لوحة محددة مسبقاً تضم 39 مستقلباً تستوفي معايير تحديد الهوية من المستوى الأول وفق MSI. اختيرت اللوحة في مسار عمل سابق مستقل وطُبّقت هنا دون تغيير، باستخدام ست معماريات تعلم خاضع للإشراف (LASSO وElastic Net وLinear SVM وPLS-DA وOPLS-DA وXGBoost). وبلغت المساحة تحت المنحنى AUC مقدار 0.928 لـ LASSO و0.949 لـ XGBoost.
تتناول الورقة قيدين متكررين في هذا المجال: الاعتماد على المصل أو البلازما بما يتطلب سحب دم وريدي وسلسلة تبريد، والتحقق من نماذج التعلم الآلي دون مراعاة الدفعات التحليلية، مما قد يضخم تقديرات الأداء. وتدرس صيغة DBS وتصميم التحقق الذي يراعي الدفعات للحد من هذه القيود.
لماذا هذا مهم
هذا هو نظير تصنيف المرض لعمل التعرف الفردي في BioTwin: نفس مصفوفة DBS قليلة التدخل والتي يمكن جمعها ذاتيًا، ونفس بروتوكول LC-MS بمختبر واحد، والآن تم تطبيقه على الكشف المبكر عن سرطان الثدي. الاستقرار عبر ست عائلات مصنفات مستقلة، بدلاً من نموذج معاير واحد، هو ما يجعل الإشارة موثوقة.
لا تثبت هذه الورقة الأولية الاستعادية للحالات والشواهد أداء الفحص الاستباقي أو الأداء لسرطانات أخرى. وتصف AUC قدرة التمييز في تصميم الدراسة، وليست احتمال إصابة الفرد بالسرطان.
المؤلفون
Nicolas Anctil (1)، Pierrick Hauguel (1)، Caroline Rhéaume (2)، Stephen Grobmyer (3)، Louis-Philippe Noel (1). المؤلف المراسل: Pierrick Hauguel (phauguel@biotwin.ai).
- قسم البحث والتطوير، BioTwin Inc.، Quebec City، QC، كندا
- Université Laval، Quebec City، QC، كندا
- معهد الأورام، مركز فاطمة بنت مبارك، Cleveland Clinic Abu Dhabi، أبو ظبي، الإمارات العربية المتحدة
تضارب المصالح: Nicolas Anctil و Pierrick Hauguel و Louis-Philippe Noel هم موظفو وأصحاب أسهم في BioTwin Inc.. Caroline Rhéaume و Stephen Grobmyer هما متعاونان أكاديميان وسريريان خارجيان.
ملاحظة مهمة: قد تناقش هذه المقالة أبحاث BioTwin، والرؤية الطبية، والمسارات السريرية المنظمة، أو التعليم الصحي والعافية من TwinMe. مخرجات العافية من TwinMe ليست اختبارات طبية أو تحليلات مختبرية. مخرجات BioTwin السريرية متاحة فقط حيث يكون ذلك مرخصًا وعبر متخصصين صحيين مؤهلين.